ATO I

Em meio a uma tempestade, o príncipe Tamino é perseguido por uma gigantesca cobra. Sem conseguir vencê-la, cai desacordado. As Três Damas, guardiãs da Rainha da Noite, chegam para salvá-lo, matando a serpente. Elas exaltam a beleza de Tamino e saem para reportar o acontecimento à Rainha da Noite. Surge Papageno, o passarinheiro trapalhão, cantando suas aventuras, quando se depara com a cobra morta e é interpelado por Tamino, para quem mente, dizendo ter ele mesmo matado a cobra. As Três Damas trancam a boca de Papageno por causa de sua mentira, e mostram uma imagem de Pamina – a filha da Rainha da Noite que fora raptada – a Tamino, que se apaixona por ela. A Rainha da Noite clama a Tamino que liberte Pamina,oferecendo-a em casamento como recompensa. Saindo à procura da princesa, Tamino encontra Papageno e lamenta a tranca em sua boca. As Três Damas surgem para tirá-lo do castigo, determinando que ele seja o guia de Tamino em sua jornada para libertar Pamina das mãos de Sarastro, entregando uma flauta mágica para o príncipe e sinos mágicos para Papageno. Monostatos, um servo obsceno e impiedoso, mantém Pamina presa, assediando-a insistentemente. Papageno, desavisado, encontra Monostatos que, apavorado, sai correndo. Pamina e Papageno cantam a esperança de encontrarem os seus amores. Guiado pelos Três Gênios, Tamino chega às portas do Templo de Ísis, onde é recebido por um Arauto. Em seu diálogo, aos poucos Tamino percebe que Sarastro não parece ser o vilão descrito pela Rainha da Noite, mas sim um mestre de grande sabedoria. Pamina e Papageno continuam sua busca por Tamino, quando são novamente flagrados por Monostatos, que ordena a prisão de ambos. Quando os escravos se aproximam, Papageno toca os sinos mágicos e faz com que todos saiam enfeitiçados pela música. Entretanto, logo em seguida são surpreendidos pela chegada de Sarastro. Pamina confessa que tentava fugir por ter sido assediada pelo cruel Monostatos. Sarastro mostra sua benevolência, explicando que fora a maldade da Rainha da Noite que fez com que ele a mantivesse presa, para que ela alcançasse a virtude e a sabedoria. Monostatos agora traz Tamino, e é repreendido e castigado por Sarastro devido ao tratamento dado a Pamina. Para a alegria de todos, Tamino e Papageno são levados ao
templo para serem consagrados à Ordem de Ísis.

Intervalo

ATO II

Inicia-se uma cerimônia no Templo. Os sacerdotes preparam a consagração de Tamino e Papageno, que devem passar pelas provações para serem aceitos na Ordem de Ísis. A primeira provação é justamente ficarem calados – uma prova dificílima para Papageno e, principalmente, para Tamino, quando Pamina fica desolada ao tentar falar com ele, sem que ele possa responder a ela. A Rainha da Noite encontra Pamina e exige que ela mate Sarastro, ameaçando banir a filha caso ela não cumpra sua determinação. A princesa, apavorada, encontra-se com Sarastro, que proclama a soberania do amor e da virtude. Papageno é interpelado por uma mulher estranha e repugnante, que alega ser sua namorada. Apavorado, ele tenta fugir dela a todo custo, quando os Três Gênios mais uma vez indicam o caminho que devem seguir. Nesse momento, Pamina encontra Tamino e fica
desolada, por seu amado não lhe dirigir nenhuma palavra. Mais uma vez se reúnem os sacerdotes, e Sarastro anuncia que o casal terá um destino feliz se passarem pelas provações, separando-os. Papageno só pensa em ter uma namorada, quando mais uma vez surge a velha, obrigando-o a recebê-la. Atordoado, Papageno fica resignado, quando repentinamente percebe que aquela mulher era, na verdade, a sua linda namorada Papagena. Mas ele ainda não pode ficar com ela: o Arauto anuncia que ele deve terminar as provas para a consagração. Separada de Tamino, Pamina fica desolada e tenta tirar a própria vida, mas é impedida pelos Três Gênios que anunciam o amor do príncipe, convencendo Pamina a lutar. Surgem então dois misteriosos homens de armadura que
anunciam as provas – Pamina conduzirá Tamino através do fogo e da água, e será consagrada junto com ele – concluindo a travessia com o auxílio de sua flauta mágica. O Coro proclama a vitória dos jovens, chamando-os para o interior do Templo. Enquanto isso, Papageno está desolado com a perda de sua namorada Papagena, e pensa em tirar a própria vida. Mais uma vez os Três Gênios intervêm, dizendo que os sinos mágicos podem trazer Papagena de volta. Tocando os sinos, Papageno encontra Papagena e celebra a alegria do amor. De repente, a Rainha da Noite, junto com as Três Damas, trama uma última emboscada ao Templo para a destruição de Sarastro, agora com o auxílio do revoltado Monostatos, mas seu intento é destruído pelo poder das luzes de Sarastro, que
os lança para as profundezas obscuras. Com a consagração de Tamino e Pamina e a queda da Rainha da Noite, Pamina é então coroada como a nova Rainha das Luzes.